夏の全国高校野球選手権大会に第１回大会（大正４年）から１度も欠けることなく参加する”皆勤校”であるように、関西学院高等部野球部は伝統ある野球部です。
2009年の夏には、実に70年ぶりに甲子園（夏の選手権大会）に出場を果たし1回戦を見事突破、校歌”空の翼”が夏の甲子園に響きました。
その後も2021年に夏の選手権大会兵庫県予選で準優勝を果たすなど、兵庫県を代表する野球部であり続けています。
2023年8月現在、約90名の部員（3年生を含む）、約30名の指導者（大学生コーチを含む）、OB・OGの皆様、保護者会一体となって全員野球で甲子園出場を目指しています。
| 1889年（明治22年） | 神戸原田の森に、宣教師W.R.ランバスによって関西学院が創立 |
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1899年（明治32年） |
旧制関西学院中学部に野球部創部 |
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1915年（大正4年） |
第1回全国中等学校優勝野球大会（現在の全国高等学校野球選手権大会）の兵庫県予選に参加 |
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1916年（大正5年） |
第2回全国中等学校優勝野球大会に兵庫県予選を勝ち抜き初出場、1回戦敗退 |
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1920年（大正9年） |
第6回全国中等学校優勝野球大会 優勝 |
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1927年（昭和2年） |
第4回選抜中等学校野球大会に初出場、1回戦敗退 |
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1928年（昭和3年） |
第5回選抜中等学校野球大会 優勝 |
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1929年（昭和4年） ～1939年（昭和14年） |
この間にも選抜大会（春）に3回、選手権大会（夏）に2回出場 |
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1998年（平成10年） |
63年ぶりに第70回選抜高校野球大会に出場、1回戦敗退 |
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2000年（平成12年） |
第82回全国高等学校野球選手権大会兵庫県予選 準優勝 |
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2009年（平成21年） |
70年ぶりに第91回全国高等学校野球選手権大会に出場、1回戦を勝ち2回戦敗退 |
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2021年（令和3年） |
第103回全国高等学校野球選手権大会兵庫県予選 準優勝 |
選抜高等学校野球大会 （春） 出場6回、優勝1回
全国高等学校野球選手権大会（夏） 出場7回、優勝1回